Bước đầu, Khanh khai nhận ngày 10-10-2023, Khanh hẹn chị Nh. đến nhà Khanh tại phòng Khu đô thị Vinhome Oceanpark, Đa Tốn, Gia Lâm, Hà Nội. Khi vào trong phòng khách, Khanh và chị Nh. xảy ra mâu thuẫn nên Khanh đã lấy dao nhọn (loại dao bản rộng khoảng 4cm, một lưỡi sắc nhọn) đâm nhiều nhát vào vùng ngực chị Nh.. Sau khi chị Nh. chết, Khanh đã lấy dao phân xác chị Nh. thành nhiều phần rồi cho toàn bộ các phần thi thể vào bên trong thùng xốp màu trắng, dùng băng dính dán kín lại.
Sau đó, Khanh gọi điện đến tổng đài hãng taxi Long Biên và thuê 1 xe taxi chở Khanh mang theo thùng xốp (bên trong đựng thi thể chị Nh.) đi đến Miếu Bản thuộc thôn Giang Cao, xã Bát Tràng. Khi đi đến bậc dẫn lên xuống sông Hồng, khu vực Miếu Bản, làng Giang Cao thì Khanh bảo tài xế taxi dừng xe và nhờ người này bê giúp thùng xốp xuống xe, để thùng xốp ở tại bậc lên xuống.
Sau khi anh lái xe dời đi, Khanh một mình bê thùng xốp đựng thi thể chị Nh. xuống sông Hồng để phi tang (Khanh vứt một số phần thi thể xuống sông Hồng và chôn giấu một phần thi thể ở mép sông Hồng). Sau khi thực hiện xong việc phi tang thi thể chị Nh., Khanh đã liên hệ với tài xế taxi quay lại đón Khanh và đưa Khanh về chung cư.
Sau khi anh lái xe dời đi, Khanh một mình bê thùng xốp đựng thi thể chị Nh. xuống sông Hồng để phi tang (Khanh vứt một số phần thi thể xuống sông Hồng và chôn giấu một phần thi thể ở mép sông Hồng). Sau khi thực hiện xong việc phi tang thi thể chị Nh., Khanh đã liên hệ với tài xế taxi quay lại đón Khanh và đưa Khanh về chung cư.
Ngay sau khi về đến chung cư, Khanh đã lấy xe máy Honda Air Blade, mang BKS 17B7- 342.XX đi đến cầu Thanh Trì vứt 2 chiếc điện thoại của chị Nh. xuống sông Hồng, giấu chiếc túi xách, dép của chị Nh. ở nhà trọ tại Thôn 2, xã Bát Tràng.
Đến chiều ngày 12-10-2023, do lo sợ thì thể chị Nh. bị phát hiện, Khanh đã đến chợ gần khu vực ngã tư Đa Tốn (Hà Nội) mua 125.000 đồng tiền xi măng mang đến khu vực giấu thi thể chị Nh. với mục đích phủ xi măng lên phía trên nơi giấu thi thể nạn nhân, do khu vực nơi giấu thi thể có đông người qua lại nên Khanh mang xi măng về nhà.
Đến rạng sáng ngày 13-10-2023, Khanh một mình quay lại vị trí nơi giấu thi thể chị Nh. và đổ xi măng phủ lên phía trên để che giấu. Chiều ngày 13-10-2023, khi biết được thông tin Cơ quan Công an đã phát hiện thi thể của chị Nh., Khanh đã đi đến bến xe Giáp Bát, đi xe khách bỏ trốn về Thái Bình.